V poslednom pokračovaní trilógie o Matrixe sa dostane Neo (Keanu Reeves) spoločne s Trinity (Carrie-Anne Moss) a Morpheom (Laurence Fishburne) do finálovej bitky proti počítačovým vládcom univerza. Zion je v podstate dobytou baštou ľudského odporu, vzbúrenci prichádzajú o jednu loď za druhou a zrada číha aj v ich radoch. Neo má navyše problém so svojou jedinečnosťou. Nie je to však iba manipulácia? A ako rozlíšiť ľudskosť od obyčajnej ilúzie? Začína akčnejší a napínavejší príbeh, než obidva predošlé...